由於卵巢癌不容易在早期被發現，常在診斷時疾病已屬於較後期，所以手術的範圍都會比較大，目標都是大範圍的將所有被侵犯的區域盡可能做切除，把肉眼看的到一公分以上的腫瘤都切除乾淨，這是卵巢癌手術治療的最高原則。此原則稱為『減積(減少腫瘤體積)手術』。

手術的方式，通常會將子宮及卵巢兩側、輸卵管、腸網膜全切除，並將骨盆腔及動脈旁淋巴結摘除乾淨。但若遇到年輕孕齡婦女，且嚴正只侵犯單側卵巢(IA期)，為了保存生育能力，可考慮只切除單側有病灶的卵巢。除了切除器官外，在手術過程中還必須將腹水送細胞學檢查，及把任何有可疑的地方做切片，以了解疾病的侵犯程度，好做為後續化學治療的重要評估依據。

由於手術的範圍很大，所以術後的併發症比較明顯，包括了急性症狀如疼痛、出血、感染、排尿及排便不順等，長期可能會出現的併發症還包括如腹腔沾黏，因而產生腹脹及腹痛的情況。

目前對於第二、三、四期的病人，在歷經手術後，使用化學治療作為術後的輔助治療，目的是希望能將殘餘的癌細胞一一根除，這已經被視為師一種有效且必要的標準治療。常用的方式多半是組合兩種藥物，例如太平洋紫杉醇(paclitaxel)、鉑製劑(cisplatin或carboplatin)、cyclophosphamide等，每隔三週給予一次，一共給予至少六次。至於復發的卵巢癌，也有二線用藥，可使用包括微脂體小紅莓Liposomal Doxorubicin、癌康定(Topotecan)及健擇(Gemccitabine)。

第一期的病人，是否需要給予化學治療，必須依照腫瘤細胞的型態、惡性度、大小與侵犯情形，由醫師仔細全盤考量治療的好處與藥物副作用的風險後再做決定。

卵巢癌化學治療的給藥途徑，以靜脈注射或腹膜腔注射為主。靜脈注射可使藥物經由血液到達全身各處，有助於疾病的全身性治療。腹膜腔注射的優點，是可使腹腔內的藥物濃度提高，有助於消滅腹膜腔內殘存的癌細胞，不過腫瘤體積不能太大，不然藥物將無法有效地滲透到腫瘤裡面。一般大多以靜脈注射或靜脈加腹膜注射同時給予，較少只給腹膜腔注射。